1、按化学成分来源和化学结构可分为：无机杀菌剂（硫磺、硫酸铜、波尔多液、石硫合剂）、有机杀菌剂（有机硫类、有机磷类、有机锡类、氨基甲酸酯类、苯并咪唑类、三唑类、杂环类）生物杀菌剂（多氧清（多抗霉素）、井冈霉素、春雷霉素、链霉素）。

2、按作用方式或机制可分为：保护剂（波尔多液、百菌清、代森锰锌）。治疗剂（甲基托布津、多菌灵、三唑酮、腈菌唑、霜脲氰）。