日本性祭祀是由性与爱而起源的神话传说开始的。历史传说中的自然神与人性息息相通，也是有人的欲求的。古代人对自然神的崇拜，也是包括对性的崇拜。所以，日本古代人对性的表现是非常坦率，也是非常认真的。比如，《古记事》《日本书纪》中所描写的伊邪那岐和伊邪那美男女二神，奉天神赦令，从天而降，她们结合的过程是：伊邪那岐和伊邪那美下凡后，看见一对情鸽亲嘴，她们也学着亲嘴；目睹一对鹡鸰结合，受到启发，不能自制，伊邪那岐男神便问到：“你的身体怎么样？”伊邪那美女神答道：“我的身体逐渐完整，惟有一处没有闭合。

起源

”伊邪那岐神就说：“我的身体有鸽多余的地方，那么就献给你吧。“伊邪那美同意了。二神于是尽情地享受性的快乐。这对男女自然的合二为一，最后生下日本诸岛，山川草木等八百万神，伊邪那岐海生下支配诸岛和天地万物的太阳女神（天照大神）等。

这男女两神的性爱的结合，被称为”神婚“，从此相传，日本的神可以泰然地享受爱与性的快乐，不存在基于宗教原因的性禁忌。日本原始信仰的另一歌特征是对生殖器的崇拜。从绳文时代的遗址可以发现象征男性生殖器的石棒和女性土偶突出的性器官。到了弥生时代，在农耕的祭祀仪式上，性器官作为农业生产力的象征，成为人们膜拜的对象。因此，日本上古石崇拜性的。最早祭祀的对象之一，就是道祖神，作为男女结缘的神，包括圆石，阴阳石和男女二体石。最早的女神雕像就是展现其生殖器，后来这一形象演化为日本式的“观音”。在神话中还有名叫猿田昆古的阴茎神，他象征着生命力。

祭祀仪式

人们抬着神的性器官象征物游行，一方面是为了驱邪，一方面以此表示对神的崇敬，让神快乐，俗称”神乐“。这种敬神活动，奠定了民间文化的基础。后来”神乐“演变为宫廷或神社祭神的一种舞乐，在近古时代，发展为能乐，狂言和歌舞伎中的一种舞乐或舞事。由于历史和文化的多重影响，所以现在仍然会有这个祭祀。