1、成分不同，绿色玛瑙也是微晶质的石英集合体，与翡翠的区别在于地质成因的不同，玛瑙的形成与火山活动有关，而翡翠则是风化淋滤的表生地质作用下形成的。

2、颜色成因不同，绿色玛瑙的颜色是人工染色的，翡翠的颜色则是天然的，所以两者的价格差别很大。不过玛瑙染成绿色并非出于仿冒翡翠的目的，而是玛瑙传统的一种加工工艺。

3、颜色不同，染色玛瑙深的如祖母绿，淡的如翠果绿、碧湖绿，颜色单板单一，在质地中伴有明显的冰块纹，看的时间长了会给人一种泛蓝的错觉，且没有翡翠特有的翠性。绿玛瑙的颜色虽然与翡翠相似，但色形不同。绿玛瑙通体一色，颜色均匀，无明显的色源和色根，而翡翠在色形中具有色源与色根。