1、组成成分不同：白质由神经元中被髓鞘包围的突起构成；灰质由大量的神经元胞体及其树突聚集而成。

2、功能不同：白质主要起传导作用，如脊髓白质主要传导脑部和脊髓灰质的兴奋；灰质是神经中枢，起支配作用，包括脊髓灰质，它也可以控制一些低级的非条件反射。

3、位置不同：在脊髓和延脑，外围主要是白质，内部是灰质；在大脑和小脑以及脑干，外围是灰质，内部是白质。